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主營(yíng)：原位雜交,亞細(xì)胞定位,蛋白互作,啟動(dòng)子篩選
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亞細(xì)胞定位是查找生物大分子在細(xì)胞內(nèi)的具體存在的位置，如在核內(nèi)、胞質(zhì)內(nèi)或者細(xì)胞膜上存在。常見的亞細(xì)胞定位方法有生物信息學(xué)預(yù)測(cè)法、熒光法、GFP融合蛋白表達(dá)法。
熒光顯微鏡技術(shù)是一種非常有用的工具，湖北亞細(xì)胞定位，可以幫助我們了解植物細(xì)胞中不同細(xì)胞器的位置和功能。通過使用不同的標(biāo)記物，我們可以定位許多其他細(xì)胞器，亞細(xì)胞定位服務(wù)，例如核糖體、囊泡和細(xì)胞壁。這些信息對(duì)于研究植物細(xì)胞的生物學(xué)過程和開發(fā)新的農(nóng)業(yè)技術(shù)都非常重要。
蛋白質(zhì)序列特征：
利用改進(jìn)型偽氨基酸組成法（PseAAC）、偽位置特異性得分矩陣法（PsePSSM）和三聯(lián)體編碼法（CT）對(duì)蛋白質(zhì)序列進(jìn)行特征提取，洋蔥亞細(xì)胞定位，并將這三種方法得到的特征向量進(jìn)行融合，以得到一個(gè)全新的蛋白質(zhì)序列特征表達(dá)模型，然后輸入到堆棧式降噪自編碼器（SDAE）深度網(wǎng)絡(luò)里自動(dòng)學(xué)習(xí)更有效的特征表示，選用 Softmax 回歸分類器進(jìn)行亞細(xì)胞的分類預(yù)測(cè)，可有效提高蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性。
利用 PSI-BLAST 工具搜索蛋白質(zhì)序列，提取位點(diǎn)特異性譜中的位點(diǎn)特異性得分矩陣作為蛋白質(zhì)的一類特征，并計(jì)算 4 等分序列的氨基酸含量以及 1～7 階二肽含量作為另外兩類特征，由這三類特征一共得到蛋白質(zhì)序列的 12 個(gè)特征向量。通過設(shè)計(jì)一個(gè)簡(jiǎn)單加權(quán)函數(shù)對(duì)各類特征向量加權(quán)處理，作為神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測(cè)器的輸入，可提高蛋白質(zhì)亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)的精度。
GFP是綠色熒光蛋白，在掃描共聚焦顯微鏡的激光照射下會(huì)發(fā)出綠色熒光，從而可以地定位蛋白質(zhì)的位置。綠色螢光蛋白（GFP）是一個(gè)由約238個(gè)氨基酸組成的蛋白質(zhì)，從藍(lán)光到紫外線都能使其激發(fā)，發(fā)出綠色熒光。通過基因工程技術(shù)，綠色螢光蛋白(GFP)基因能轉(zhuǎn)進(jìn)不同物種的基因組，在后代中持續(xù)表達(dá)，亞細(xì)胞定位方法，并且能根據(jù)啟動(dòng)子特異性地表達(dá)。
使用GFP必須構(gòu)建融合蛋白載體，并在轉(zhuǎn)染之后有效表達(dá)。這樣，若在熒光顯微鏡下看到細(xì)胞內(nèi)某一部位存在GFP信號(hào)，說(shuō)明和GFP融合的蛋白也存在于該部位，這樣就達(dá)到了確定某物質(zhì)亞細(xì)胞定位的目的。
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第3年
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